~bzr-pqm/bzr/bzr.dev

« back to all changes in this revision

Viewing changes to doc/developers/inventory.txt

  • Committer: Martin Pool
  • Date: 2005-05-09 04:38:31 UTC
  • Revision ID: mbp@sourcefrog.net-20050509043831-d45f7832b7d4d5b0
- better message when refusing to add symlinks (from mpe)

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
1
 
===========
2
 
Inventories
3
 
===========
4
 
 
5
 
.. contents::
6
 
 
7
 
Overview
8
 
========
9
 
 
10
 
Inventories provide an abstraction for talking about the shape of a tree.
11
 
Generally only tree object implementors should be concerned about entire
12
 
inventory objects and their implementation. Other common exceptions are
13
 
full-tree operations such as 'checkout', 'export' and 'import'.
14
 
 
15
 
In memory inventories
16
 
=====================
17
 
 
18
 
In memory inventories are often used in diff and status operations between
19
 
trees. We are working to reduce the number of times this occurs with 'full
20
 
tree' inventory objects, and instead use more custom tailored data structures
21
 
that allow operations on only a small amount of data regardless of the size of
22
 
the tree.
23
 
 
24
 
 
25
 
Serialization
26
 
=============
27
 
 
28
 
There are several variants of serialised tree shape in use by bzr. To date
29
 
these have been mostly xml based, though plugins have offered non-xml versions.
30
 
 
31
 
dirstate
32
 
--------
33
 
 
34
 
The dirstate file in a working tree includes many different tree shapes - one
35
 
for the working tree and one for each parent tree, interleaved to allow
36
 
efficient diff and status operations.
37
 
 
38
 
xml
39
 
---
40
 
 
41
 
All the xml serialized forms write to and read from a single byte string, whose
42
 
hash is then the inventory validator for the commit object.
43
 
 
44
 
 
45
 
Serialization scaling and future designs
46
 
========================================
47
 
 
48
 
Overall efficiency and scaling is constrained by the bottom level structure
49
 
that an inventory is stored as. We have a number of goals we want to achieve:
50
 
 
51
 
 1. Allow commit to write less than the full tree's data in to the repository
52
 
    in the general case. 
53
 
 2. Allow the data that is written to be calculated without examining every
54
 
    versioned path in the tree.
55
 
 3. Generate the exact same representation for a given inventory regardless of
56
 
    the amount of history available.
57
 
 4. Allow in memory deltas to be generated directly from the serialised form
58
 
    without upcasting to a full in-memory representation or examining every
59
 
    path in the tree. Ideally the work performed will be proportional to the
60
 
    amount of changes between the trees being compared.
61
 
 5. Allow fetch to determine the file texts that need to be pulled to ensure
62
 
    that the entire tree can be reconstructed without having to probe every
63
 
    path in the tree.
64
 
 6. Allow bzr to map paths to file ids without reading the entire serialised
65
 
    form. This is something that is used by commands such as merge PATH and
66
 
    diff -r X PATH.
67
 
 7. Let bzr map file ids to paths without reading the entire serialised form.
68
 
    This is used by commands that are presenting output to the user such as
69
 
    loggerhead, bzr-search, log FILENAME.
70
 
 8. We want a strong validator for inventories which is cheap to generate.
71
 
    Specifically we should be able to create the generator for a new commit
72
 
    without processing all the data of the basis commit.
73
 
 9. Testaments generation is currently size(tree), we would like to create a
74
 
    new testament standard which requires less work so that signed commits
75
 
    are not significantly slower than regular commits.
76
 
 
77
 
 
78
 
We have current performance and memory bugs in log -v, merge, commit, diff -r,
79
 
loggerhead and status -r which can be addressed by an inventory system
80
 
meeting these goals.
81
 
 
82
 
Current situation
83
 
-----------------
84
 
 
85
 
The xml based implementation we use today layers the inventory as a bytestring
86
 
which is stored under a single key; the bytestring is then compressed as a 
87
 
delta against the bytestring of its left hand parent by the knit code.
88
 
 
89
 
Gap analysis:
90
 
 
91
 
 1. Succeeds
92
 
 2. Fails - generating a new xml representation needs full tree data.
93
 
 3. Succeeds - the inventory layer accesses the bytestring, which is
94
 
    deterministic
95
 
 4. Fails - we have to reconstruct both inventories as trees and then delta
96
 
    the resulting in memory objects.
97
 
 5. Partial success - the revision field in the inventory can be scanned for
98
 
    in both text-delta and full-bytestring form; other revision values than
99
 
    those revisions which are being pulled are by definition absent.
100
 
 6. Partially succeeds - with appropriate logic a path<->id map can be generated
101
 
    just-in-time, but it is complex and still requires reconstructing the
102
 
    entire byte-string.
103
 
 7. As for 6.
104
 
 8. Fails - we have to hash the entire tree in serialised form to generate
105
 
    validators.
106
 
 9. Fails.
107
 
 
108
 
Long term work
109
 
--------------
110
 
 
111
 
Some things are likely harder to fix incrementally than others. In particular,
112
 
goal 3 (constant canonical form) is arguably only achieved if we remove all
113
 
derived data such as the last-modified revision from the inventory itself. That
114
 
said, the last-modified appears to be in a higher level than raw serialization.
115
 
So in the medium term we will not alter the contents of inventories, only the
116
 
way that the current contents are mapped to and from disk.
117
 
 
118
 
 
119
 
Layering
120
 
--------
121
 
 
122
 
We desire clear and clean layers. Each layer should be as simple as we can make
123
 
it to aid in debugging and performance tuning. So where we can choose to either
124
 
write a complex layer and something simple on top of it, or two layers with
125
 
neither being as complex - then we should consider the latter choice better in
126
 
the absence of compelling reasons not to.
127
 
 
128
 
Some key layers we have today and can look at using or tweaking are:
129
 
 
130
 
 * Tree objects - the abstract interface bzrlib code works in
131
 
 * VersionedFiles - the optionally delta compressing key->bytes storage
132
 
   interface.
133
 
 * Inventory - the abstract interface that many tree operations are written in.
134
 
 
135
 
These layers are probably sufficient with minor tweaking. We may want to add
136
 
additional modules/implementations of one or more layers, but that doesn't
137
 
really require new layers to be exposed.
138
 
 
139
 
Design elements to achieve the goals in a future inventory implementation
140
 
-------------------------------------------------------------------------
141
 
 
142
 
 * Split up the logical document into smaller serialised fragements. For
143
 
   instance hash buckets or nodes in a tree of some sort. By serialising in 
144
 
   smaller units, we can increase the number of smaller units rather than 
145
 
   their size as the tree grows; as long as two similar trees have similar
146
 
   serialised forms, the amount of different content should be quite high.
147
 
 
148
 
 * Use fragment identifiers that are independent of revision id, so that
149
 
   serialisation of two related trees generates overlap in the keyspace
150
 
   for fragments without requiring explicit delta logic. Content Hash Keys
151
 
   (e.g. ('sha1:ABCDEF0123456789...',) are useful here because of the ability
152
 
   to assign them without reference to history.)
153
 
 
154
 
 * Store the fragments in our existing VersionedFiles store. Adding an index
155
 
   for them. Have the serialised form be uncompressed utf8, so that delta logic
156
 
   in the VersionedFiles layer can be used. We may need to provide some sort
157
 
   of hinting mechanism to get good compression - but the trivially available
158
 
   zlib compression of knits-with-no-deltas is probably a good start.
159
 
 
160
 
 * Item_keys_introduced_by is innately a history-using function; we can
161
 
   reproduce the text-key finding logic by doing a tree diff between any tree
162
 
   and an older tree - that will limit the amount of data we need to process
163
 
   to something proportional to the difference and the size of each fragment.
164
 
   When checking many versions we can track which fragments we have examined
165
 
   and only look at new unique ones as each version is examined in turn.
166
 
 
167
 
 * Working tree to arbitrary history revision deltas/comparisons can be scaled
168
 
   up by doing a two-step (fixed at two!) delta combining - delta(tree, basis)
169
 
   and then combine that with delta(basis, arbitrary_revision) using the 
170
 
   repositories ability to get a delta cheaply.
171
 
 
172
 
 * The key primitives we need seem to be:
173
 
   * canonical_form(inventory) -> fragments
174
 
   * delta(inventory, inventory) -> inventory_delta
175
 
   * apply(inventory_delta, canonical_form) -> fragments
176
 
 
177
 
 * Having very many small fragments is likely to cause a high latency
178
 
   multiplier unless we are careful.
179
 
 
180
 
 * Possible designs to investigate - a hash bucket approach, radix trees,
181
 
   B+ trees, directory trees (with splits inside a directory?).
182
 
 
183
 
 
184
 
Hash bucket based inventories
185
 
=============================
186
 
 
187
 
Overview
188
 
--------
189
 
 
190
 
We store two maps - fileid:inventory_entry and path:fileid, in a stable
191
 
hash trie, stored in densly packed fragments. We pack keys into the map
192
 
densely up the tree, with a single canonical form for any given tree. This is
193
 
more stable than simple fixed size buckets, which prevents corner cases where
194
 
the tree size varies right on a bucket size border. (Note that such cases are
195
 
not a fatal flaw - the two forms would both be present in the repository, so
196
 
only a small amount of data would be written at each transition - but a full
197
 
tree reprocess would be needed at each tree operation across the boundary, and
198
 
thats undesirable.)
199
 
 
200
 
Goal satisfaction
201
 
-----------------
202
 
 
203
 
 1. Success
204
 
 2. Success
205
 
 3. Success
206
 
 4. Success, though each change will need its parents looked up as well
207
 
    so it will be proportional to the changes + the directories above
208
 
    the changed path.
209
 
 5. Success - looking at the difference against all parents we can determine
210
 
    new keys without reference to the repository content will be inserted
211
 
    into.
212
 
 6. This probably needs a path->id map, allowing a 2-step lookup.
213
 
 7. If we allocate buckets by hashing the id, then this is succeed, though,
214
 
    as per 4 it will need recursive lookups.
215
 
 8. Success
216
 
 9. Fail - data beyond that currently included in testaments is included
217
 
    in the strong validator.
218
 
 
219
 
Issues
220
 
------
221
 
 
222
 
 1. Tuning the fragment size needs doing.
223
 
 1. Testing.
224
 
 1. Writing code.
225
 
 1. Separate root node, or inline into revision?
226
 
 1. Cannot do 'ls' efficiently in the current design.
227
 
 1. Cannot detect invalid deltas easily.
228
 
 1. What about LCA merge of inventories?
229
 
 
230
 
Canonical form
231
 
--------------
232
 
 
233
 
There are three fragment types for the canonical form. Each fragment is
234
 
addressed using a Content Hash Key (CHK) - for instance
235
 
"sha1:12345678901234567890".
236
 
 
237
 
root_node: (Perhaps this should be inlined into the revision object).
238
 
HASH_INVENTORY_SIGNATURE
239
 
path_map: CHK to root of path to id map
240
 
content_map: CHK to root of id to entry map
241
 
 
242
 
map_node: INTERNAL_NODE or LEAF_NODE
243
 
INTERNAL_NODE:
244
 
INTERNAL_NODE_SIGNATURE
245
 
hash_prefix: PREFIX
246
 
prefix_width: INT
247
 
PREFIX CHK TYPE SIZE
248
 
PREFIX CHK TYPE SIZE ...
249
 
 
250
 
(Where TYPE is I for internal or L for leaf).
251
 
 
252
 
leaf_node:
253
 
LEAF_NODE_SIGNATURE
254
 
hash_prefix: PREFIX
255
 
HASH\x00KEY\x00 VALUE
256
 
 
257
 
For path maps, VALUE is::
258
 
  fileid
259
 
 
260
 
For content maps, VALUE::
261
 
  fileid basename kind last-changed kind-specific-details
262
 
 
263
 
 
264
 
The path and content maps are populated simply by serialising every inventory
265
 
entry and inserting them into both the path map and the content map. The maps
266
 
start with just a single leaf node with an empty prefix. 
267
 
 
268
 
 
269
 
Apply
270
 
-----
271
 
 
272
 
Given an inventory delta - a list of (old_path, new_path, InventoryEntry)
273
 
items, with a None in new_path indicating a delete operation, and recursive
274
 
deletes not being permitted - all entries to be deleted must be explicitly
275
 
listed, we can transform a current inventory directly. We can't trivially
276
 
detect an invalid delta though.
277
 
 
278
 
To perform an application, naively we can just update both maps. For the path
279
 
map we would remove all entries where the paths in the delta do not match, then
280
 
insert those with a new_path again. For the content map we would just remove
281
 
all the fileids in the delta, then insert those with a new_path that is not
282
 
None.
283
 
 
284
 
Delta
285
 
-----
286
 
 
287
 
To generate a delta between two inventories, we first generate a list of
288
 
altered fileids, and then recursively look up their parents to generate their
289
 
old and new file paths.
290
 
 
291
 
To generate the list of altered file ids, we do an entry by entry comparison of
292
 
the full contents of every leaf node that the two inventories do not have in
293
 
common. To do this, we start at the root node, and follow every CHK pointer
294
 
that is only in one tree. We can then bring in all the values from the leaf
295
 
nodes and do a set difference to get the altered ones, which we would then
296
 
parse.
297
 
 
298
 
 
299
 
Radix tree based inventories
300
 
============================
301
 
 
302
 
Overview
303
 
--------
304
 
 
305
 
We store two maps - fileid:path and path:inventory_entry. The fileid:path map
306
 
is a hash trie (as file ids have no useful locality of reference). The
307
 
path:inventory_entry map is stored as a regular trie. As for hash tries we
308
 
define a single canonical representation for regular tries similar to that
309
 
defined above for hash tries.
310
 
 
311
 
Goal satisfaction
312
 
-----------------
313
 
 
314
 
 1. Success
315
 
 2. Success
316
 
 3. Success
317
 
 4. Success
318
 
 5. Success - looking at the difference against all parents we can determine
319
 
    new keys without reference to the repository content will be inserted
320
 
    into.
321
 
 6. Success
322
 
 7. Success
323
 
 8. Success
324
 
 9. Fail - data beyond that currently included in testaments is included
325
 
    in the strong validator.
326
 
 
327
 
Issues
328
 
------
329
 
 
330
 
 1. Tuning the fragment size needs doing.
331
 
 1. Testing.
332
 
 1. Writing code.
333
 
 1. Separate root node, or inline into revision?
334
 
 1. What about LCA merge of inventories?
335
 
 
336
 
Canonical form
337
 
--------------
338
 
 
339
 
There are five fragment types for the canonical form:
340
 
 
341
 
The root node, hash trie internal and leaf nodes as previous.
342
 
 
343
 
Then we have two more, the internal and leaf node for the radix tree.
344
 
 
345
 
radix_node: INTERNAL_NODE or LEAF_NODE
346
 
 
347
 
INTERNAL_NODE:
348
 
INTERNAL_NODE_SIGNATURE
349
 
prefix: PREFIX
350
 
suffix CHK TYPE SIZE
351
 
suffix CHK TYPE SIZE ...
352
 
 
353
 
(Where TYPE is I for internal or L for leaf).
354
 
 
355
 
LEAF_NODE:
356
 
LEAF_NODE_SIGNATURE
357
 
prefix: PREFIX
358
 
suffix\x00VALUE
359
 
 
360
 
For the content map we use the same value as for hashtrie inventories.
361
 
 
362
 
 
363
 
Node splitting and joining in the radix tree are managed in the same fashion as
364
 
as for the internal nodes of the hashtries.
365
 
 
366
 
 
367
 
Apply
368
 
-----
369
 
 
370
 
Apply is implemented as for hashtries - we just remove and reinsert the
371
 
fileid:paths map entries, and likewise for the path:entry map. We can however
372
 
cheaply detect invalid deltas where a delete fails to include its children.
373
 
 
374
 
Delta
375
 
-----
376
 
 
377
 
Delta generation is very similar to that with hash tries, except we get the
378
 
path of nodes as part of the lookup process.
379
 
 
380
 
 
381
 
Hash Trie details
382
 
=================
383
 
 
384
 
The canonical form for a hash trie is a tree of internal nodes leading down to
385
 
leaf nodes, with no node exceeding some threshold size, and every node
386
 
containing as much content as it can, but no leaf node containing less than
387
 
its lower size threshold. (In the event that an imbalance in the hash function
388
 
causes a tree where an internal node is needed, but any prefix generates a
389
 
child with less than the lower threshold, the smallest prefix should be taken).
390
 
An internal node holds some number of key prefixes, all with the same bit-width.
391
 
A leaf node holds the actual values. As trees do not spring fully-formed, the
392
 
canonical form is defined iteratively - by taking every item in a tree and
393
 
inserting it into a new tree in order you can determine what canonical form
394
 
would look like.  As that is an expensive operation, it should only be done
395
 
rarely.
396
 
 
397
 
Updates to a tree that is in canonical form can be done preserving canonical
398
 
form if we can prove that our rules for insertion are order-independent,
399
 
and that our rules for deletion generate the same tree as if we never
400
 
inserted those nodes.
401
 
 
402
 
Our hash tries are balanced vertically but not horizontally. That is, one leg
403
 
of a tree can be arbitrarily deeper than adjacent legs. We require that each
404
 
node along a path within the tree be densely packed, with the densest nodes
405
 
near the top of the tree, and the least dense at the bottom. Except where the
406
 
tree cannot support it, no node is smaller than a minimum_size, and none
407
 
larger than maximum_size. The minimum size constraint is only applied when
408
 
there are enough entries under a prefix to meet that minimum. The maximum
409
 
size constraint is always applied except when a node with a single entry
410
 
is larger than the maximum size. Loosely, the maximum size constraint wins
411
 
over the minimum size constraint, and if the minimum size contraint is to
412
 
be ignored, a deeper prefix can be chosen to pack the containing node more
413
 
densely, as long as no additional minimum sizes checks on child nodes are
414
 
violated.
415
 
 
416
 
Insertion
417
 
---------
418
 
 
419
 
#. Hash the entry, and insert the entry in the leaf node with a matching
420
 
   prefix, creating that node and linking it from the internal node containing
421
 
   that prefix if there is no appropriate leaf node.
422
 
#. Starting at the highest node altered, for all altered nodes, check if it has
423
 
   transitioned across either size boundary - 0 < min_size < max_size. If it
424
 
   has not, proceed to update the CHK pointers.
425
 
#. If it increased above min_size, check the node above to see if it can be
426
 
   more densely packed. To be below the min_size the node's parent must
427
 
   have hit the max size constraint and been forced to split even though this
428
 
   child did not have enough content to support a min_size node - so the prefix
429
 
   chosen in the parent may be shorter than desirable and we may now be able
430
 
   to more densely pack the parent by splitting the child nodes more. So if the
431
 
   parent node can support a deeper prefix without hitting max_size, and the
432
 
   count of under min_size nodes cannot be reduced, the parent should be given
433
 
   a deeper prefix.
434
 
#. If it increased above max_size, shrink the prefix width used to split out
435
 
   new nodes until the node is below max_size (unless the prefix width is
436
 
   already 1 - the minimum).
437
 
   To shrink the prefix of an internal node, create new internal nodes for each
438
 
   new prefix, and populate them with the content of the nodes which were
439
 
   formerly linked. (This will normally bubble down due to keeping densely
440
 
   packed nodes).
441
 
   To shrink the prefix of a leaf node, create an internal node with the same
442
 
   prefix, then choose a width for the internal node such that the contents 
443
 
   of the leaf all fit into new leaves obeying the min_size and max_size rules.
444
 
   The largest prefix possible should be chosen, to obey the
445
 
   higher-nodes-are-denser rule. That rule also gives room in leaf nodes for 
446
 
   growth without affecting the parent node packing.
447
 
#. Update the CHK pointers - serialise every altered node to generate a CHK,
448
 
   and update the CHK placeholder in the nodes parent; then reserialise the
449
 
   parent. CHK pointer propogation can be done lazily when many updates are
450
 
   expected.
451
 
 
452
 
Multiple versions of nodes for the same PREFIX and internal prefix width should
453
 
compress well for the same tree.