Write out a placeholder for parent info when a file is added.

  * When a file is added it's parent information is not known, but it is
    required to be in the file.
  * There is a problem with this fix though, as if the file is read in
    and then written back out this information will be filtered out and lost.
  * Test case for seeing the problem is
    test_clone_preserves_content.\*WorkingTreeFormat4